Клуб выпускников МГУ (Московский Государственный Университет)
 

Ученые МГУ выяснили, как повлиять на активность хромосом

Ученые МГУ выяснили, как повлиять на активность хромосом

Сотрудники биологического факультета МГУ детально изучили динамику взаимодействия H2A-H2B димеров гистонового кора - белкового комплекса, на который наматывается ДНК в хромосомах. Исследование было выполнено при поддержке Минобрнауки России в рамках проекта «Наука и университеты», его результаты опубликованы в журнале Cells. 

Длина молекулы ДНК человека составляет примерно 170 см. Причем столь длинная молекула содержится в каждой клетке организма, которых у среднего человека около 30 триллионов. Чтобы геном был компактным, длинная молекула ДНК намотана на специальные белки, как нитка на систему катушек, и от того, каким именно образом она намотана, зависит работа генома. Например, гены, ДНК которых упакована с редким расположением катушек, будут считываться легче и чаще, чем гены с плотной упаковкой. Катушка, на которую наматывается ДНК, называется нуклеосомой. Она состоит из 8 молекул белков гистонов H2A, H2B, H3 и H4 - в составе по две молекулы каждого вида. 

Помимо обеспечения компактизации ДНК, нуклеосомы участвуют в регуляции работы генома. Важную роль в этом играют димеры H2A-H2B. Они стабилизируют общую структуру нуклеосомы и контролируют ее активность. Например, делают возможными разворачивание молекулы ДНК и её движение вдоль нуклеосомы. Если работа гистонового кора плохо контролируется, это может привести к развитию заболеваний, в частности, онкологических.

Несмотря на важность происходящих процессов, все еще неясно, как именно H2A-H2B димеры участвуют в работе нуклеосом. Команда исследователей кафедры биоинженерии биологического факультета МГУ решила изучить динамику этих процессов. Для этого ученые использовали метод полноатомного молекулярного моделирования, для которого понадобились вычислительные мощности суперкомпьютера МГУ «Ломоносов-2». Этот метод позволяет детально рассмотреть проходящие динамические процессы на субмолекулярных уровнях, а также лучше понять, как связаны между собой разные этапы таких взаимодействий. Для исследований использовали гистоны гладкой шпорцевой лягушки - классического модельного объекта в биологии. Учёные проводили моделирование двух типов систем: свободного димера гистонов H2A-H2B и полной нуклеосомной коровой частицы из 8 молекул гистонов и ДНК.

Результаты показали, что димеры в свободной форме имеют большую динамику, чем в составе нуклеосомы. Кроме того, исследователи обнаружили, что образование стабильных контактов между димером и ДНК приводит к изгибанию ДНК, а также смещению изгиба димера в сторону этих контактов. То есть, общая динамика сгибания димера зависит от того, как он взаимодействует с ДНК. Ученые также смогли проанализировать, что на такую динамику влияет и то, насколько изогнулась ДНК. 

«Хроматин - нуклеопротеид клеточного ядра, составляющий основу хромосом, является динамичной структурой и через изменение динамических свойств каркасных частей хроматина происходит регулирование его функций. Тонкие моды динамики гистонов уже были показаны в ряде исследований структуры нуклеосомы, однако их значение до сих пор не было раскрыто. В нашей работе была показана связь между динамикой гистонов и функционально-важной динамикой ДНК, а также выдвинуты гипотезы о механизме регулирования активности хроматина в результате изменения последовательности гистонов», - пояснила первый автор исследования, аспирант кафедры биоинженерии биологического факультета МГУ Анастасия Князева.

Страница сайта http://moscowuniversityclub.ru
Оригинал находится по адресу http://moscowuniversityclub.ru/home.asp?artId=16672