Клуб выпускников МГУ (Московский Государственный Университет) |
Математическое моделирование в геронтологии
На вопросы Фонда «Наука за продление жизни» отвечают российские ученые Василий Новосельцев и Анатолий Михальский. Вместо эпиграфа: Математическое моделирование в геронтологии - новое перспективное направление исследований, востребованное в различных областях науки. Уже сегодня математическое моделирование играет принципиальную роль в изучении различных аспектов процессов старения в биологических системах. По мнению авторитетных ученых, его значение для современной геронтологии трудно переоценить. - Математическое моделирование - сравнительно новый вид научного исследования. Когда и почему оно возникло? Василий Новосельцев: Математическое моделирование как направление появилось в 50-е годы XX века в связи с нуждами ракетных систем - для решения задач наведения снарядов на маневрирующие цели. - Для чего необходимо математическое моделирование? Василий Новосельцев: Роль моделирования в геронтологии - это, прежде всего, создание моделей и вычислительных методов для комплексного изучения и анализа процессов старения у различных видов животных и человека, а также для проверки и формирования гипотез старения. Оно позволяет лучше понять: как устроена биосистема, какие факторы на нее влияют, проанализировать и спрогнозировать ее поведение, представить общую картину взаимосвязей между процессами, происходящими на клеточном уровне и реакциями целостного организма. - Экспериментальные биологи довольно долго скептически относились к математическим моделям. Василий Новосельцев: Американский биолог Майкл Роуз (Michael Rose) однажды написал: «Математики, физики и специалисты в области математической популяционной генетики могут плести обширные сети математических теорий, которые кажутся полностью лишенными эмпирического значения». - В «Эволюции концепций в геронтологии» Владимир Анисимов и Михаил Соловьев предположили, что: «Прогресс в молекулярной биологии и информатике обеспечил основные необходимые условия для перехода от качественной, аналитической и экспериментальной геронтологии к количественной, синтетической и вычислительной. Окончательная реализация этой парадигмы приведет к тому, что основной объем знаний будет получаться из вычислительных, а не из натурных экспериментов (это произойдет, когда будут досконально поняты, вплоть до создания точных кибернетических моделей, все законы функционирования живой материи и будет достигнута необходимая вычислительная мощность компьютеров)». Возможно ли это? Василий Новосельцев: Но, к сожалению, математическая модель ничего доказать не может. Можно проверить гипотезу на непротиворечивость, но не на достаточность. Любая модель может только предсказать те или иные явления, даже пусть качественно новые. Удостовериться в их существовании или отсутствии можно только экспериментально. - А нельзя ли исключительно математическими методами, зная как в лаборатории выживают модельные объекты, посчитать кто и почему долго живет? Анатолий Михальский: Есть такие методы. Они не имеют никакого отношения ни к биологии, ни к демографии - это математические методы: методы решения некорректных обратных задач. Сам по себе это очень интересный раздел математической физики. - И чем эти задачи интересны? Анатолий Михальский: Тем, что напрямую теоретически их решать нельзя. - Можно пример? Анатолий Михальский: Например, в зависимости от того, какой сезон, какая влажность - можно анализировать влияние этих факторов на продолжительность жизни насекомых, на зависимость смертности от возраста, на старение. - С чем связано стремительное развитие моделирования в геронтологии? Василий Новосельцев: Ну, во-первых, не только в геронтологии. А во-вторых, действительно, изучение процессов старения на компьютерных моделях уже дало название новой дисциплине - «геронтология in silico» (in silico - в кремнии, т.е. в компьютере). - Вы имеете в виду рост продолжительности жизни в развитых странах? Анатолий Михальский: И даже в не очень развитых. Василий Новосельцев: Соответственно выросли государственные расходы на пенсионное обслуживание. И тогда стали финансироваться исследования, которые позволили бы понять, какие финансовые средства на пенсионные выплаты понадобятся в будущем. Анатолий Михальский: В связи с постарением населения возникли вопросы: почему растет продолжительность жизни? какие механизмы стоят за этим? что будет, если рост продолжительности жизни продолжится? каков предел видовой продолжительности жизни человека? - И почему растет продолжительность жизни? Можно ли считать этот процесс следствием улучшения качества жизни пожилых людей? Василий Новосельцев: В журнале «Science» в 2002 году была опубликована интересная статья Джима Оппена (Jim Oeppen)и Джеймса Вопеля (James Vaupel) называвшаяся «Разрушенные пределы продолжительности жизни». - То есть? Василий Новосельцев: Было подсчитано, что в стране-лидере каждые десять лет наблюдается увеличение продолжительности жизни на 2,5 года. И на графике этот рост отражается ровной прямой линией, хотя страны-лидеры и меняют друг друга. На графике: увеличение средней продолжительности жизни женщин в странах-лидерах. Анатолий Михальский: Увеличение на 2,5 года каждые десять лет - то есть квартал в год. Василий Новосельцев: Это очень серьезный рост. Анатолий Михальский: И вот авторы статьи обратили внимание, что идет независимый от социального развития рост максимальной продолжительности жизни. А почему это происходит - пока не ясно. Надо изучать. - Есть предположения, почему это происходит? Анатолий Михальский: Да, конечно, есть разные причины, которые очевидно объясняют это увеличение продолжительности жизни: улучшение условий жизни, здравоохранения, гигиены, питания… Василий Новосельцев: Вот, кстати, открытие пенициллина на этой кривой, точнее, прямой линии никак не отразилось... - И как это можно объяснить? Василий Новосельцев: Вот это удивительный факт. Все говорят: пенициллин… А прямая линия как шла, так и шла… Никак его появление не сказалось. Анатолий Михальский: Ну, гигиена спасает в средних возрастах... А вот почему люди жить стали долго, пока не ясно. - Да, конечно. Василий Новосельцев: Но пока - в пожилом возрасте почти каждый человек требует ухода со стороны молодого человека.. Получается, что общество «меняет» молодого человека на старого. Анатолий Михальский: И когда это поняли, стало ясно, что надо изучать закономерности изменения здоровой жизни. - Расскажите, пожалуйста, подробнее о деятельности вашей Лаборатории. Василий Новосельцев: Математика - универсальный язык. Она способна объединить не только результаты различных экспериментов, но и разные дисциплины. Наша лаборатория этим и занимается. Как связать между собой различные науки, различные дисциплины, какие интерфейсы между ними должны быть, чтобы дисциплины взаимодействовали? - это задачи, которые может решить и решает математика. Анатолий Михальский: А геронтология - наука междисциплинарная. Она включает в себя биологию, демографию, биохимию, биофизику, генетику, медицину и т.д. - Относительно рано, это когда? Василий Новосельцев: В конце 70-х - начале 80-х годов XX века в геронтологии были лишь отдельные работы по математическому моделированию. На Украине тогда существовал Институт геронтологии, но математических работ там не велось. Анатолий Михальский: В 90-х годах работа по математическому моделированию старения шла уже полным ходом. Появилось понимание, что старение можно связать с увеличением с возрастом вероятности смерти. С формальной точки зрения это наиболее удобное и конструктивное определение старения. Были разработаны методы, позволяющие понять, насколько стар организм, вычислены определенные биологические закономерности. Василий Новосельцев: И возникла задача построения междисциплинарных моделей. Один из способов их построения - мое личное достижение. В 1992 году я разработал междисциплинарный подходое к моделированию сложных биологических систем. - Василий Николаевич, кроме того, Вы с коллегами разработали системную гомеостатическую модель процесса старения и смертности. Василий Новосельцев: Одна из наиболее перспективных на сегодняшний день теорий старения - свободно-радикальная теория, выдвинутая в 1955 году Дэнхемом Харманом (Denham Harman). В 1989 году академик Александ Михайлович Уголев опубликовал работу «Естественные технологии биологических систем», где рассмотрел пищеварительную систему и ее участки, выполняющие разные функции (порядка двадцати), как совокупность естественных технологий. Эта модель понравилась мне своей технологичностью. И я подумал, что организм - тоже структура, нуждающаяся в веществах и энергии. Как известно, за поступление веществ в организм отвечает желудочно-кишечный тракт. Из веществ можно извлечь энергию, но перед этим ее нужно окислить. Окислитель - кислород - поступает через систему дыхания. Продукты обмена, шлаки можно преобразовать и направить обратно: этим занимается печень. А окончательные отходы выводят почки. Эта модель была сначала предназначена для анализа токсикологических задач. Моделировались отравления хлором, аммиаком, ядами бледной поганки… И они модулируют процесс старения. То есть индивидуальное старение - это снижение темпов потребления кислорода, снижение устойчивости организма к к внутренним и внешним стрессовым воздействиям. Если посчитать экспоненту (как человек старится и как к 100 годам умирает), то на нее будут накладываться аллостатические нагрузки, которые будут сдвигать ее. И человек вместо 100 проживет 80 или 90 лет. - Что отличает эту модель от других, рассматривающих старение как следствие оксидантные повреждений? Василий Новосельцев: Я рассматриваю не процесс накопления поврежденных белков из-за действия активных форм кислорода, меня интересует лишь то, как они ухудшают естественные функции организма. Идея в том, чтобы не рассматривать этот промежуточный элемент - накопление. Накопление - относительно. Копить можно вечно… - Но активные формы кислорода тоже нужны организму. Василий Новосельцев: Действительно нужны. Активные формы кислорода борются с бактериями и вирусами, участвуют в реализации жизненных процессов. И если оставить организм совсем без активных форм кислорода, то он не дай бог, умрет от того же гриппа. - Вами была сделана попытка оценить видовую продолжительность жизни человека на основании данных о максимальном и минимальном потреблении кислорода, необходимом для поддержания жизнедеятельности. К каким выводам Вы пришли? Василий Новосельцев: Мы обработали данные многочисленных экспериментов, как с возрастом снижаются цифры максимального потребления кислорода у человека. Причем эти данные относились как к людям, ведущим сидячий образ жизни, так и к активным людям, порознь к мужчинам и женщинам. Когда минимально необходимого темпа поступления кислорода организм уже не сможет обеспечить даже при максимальном усилии, наступает смерть от старости. А возраст, в котором такое произойдет, легко считается математически. Результатом такого подхода стала оценка видового предела продолжительности жизни у человека. Она оказалась разной для мужчин и женщин, разной для людей, ведущих активный и сидячий образ жизни. Максимальные цифры - в годах - 133 плюс-минус 11. Это у мужчин, ведущих активный образ жизни. А у женщин максимальный возраст до смерти от старости - при сидячем образе жизни - 123 плюс-минус 8 лет. Разумеется, такого возраста может достичь только человек, у которого «аллостатическая нагрузка» нулевая. - Одна из самых известных, часто используемых исследователями математических моделей - закон смертности Гомпертца. В чем ее универсальность? Анатолий Михальский: В 1825 году математик Бенджамин Гомпертц (Benjamin Gompertz), служивший актуáрием в страховой компании, вывел простую формулу (фактически модель данных) для расчета страховых премий. Уравнение описывало увеличивающуюся с возрастом вероятность смерти и выглядело так: Чуть позже другой страховой агент Уильям Мейкхем (William Makeham) ввёл в это уравнение новый параметр - А, отражающий смертность, не зависящую от возраста:
График 1 (слева): Вероятность смерти в зависимости от возраста График 2 (справа): Размер популяции Закон смертности Гомпертца-Мейкхама наилучшим образом описывает распределение продолжительности жизни (динамику смертности) разных, (но не всех биологических видов), включая человека, в ограниченном возрастном диапазоне (30-60 лет). Тем не менее, по этой формуле оказалось возможным не только предсказывать будущие шансы дожития (предстоящую продолжительность жизни при тех или иных обстоятельствах), но рассматривать начальную смертность и темп старения. Модель Гомпертца-Мейкхама дала импульс к развитию математической демографии, и в некотором роде, математической геронтологии. Эта модель позволяет делать выводы, далеко идущие за простое описание кривой смертности. В дальнейшем это наблюдение получило название корреляции Стрелера-Милдвана и статус фундаментальной закономерности. Следуя этой закономерности увеличение продолжительности жизни людей должно приводить к «ректангуляризации» кривой дожития. То есть, в идеале все должны умирать в одинаковом возрасте, соответствующем видовой продолжительности жизни человека. График 3: Зависимость смертности от возраста мужского населения Швеции в XIX-XX веках - 1860-1920. Уменьшение детской смертности и члена Мейкхама Аналогичные изменения на кривой дожития наблюдаются и при изменении температуры содержания нематод C.elegans - червей дикого типа. А для долгоживущих мутантов это не так. Для них растягивается шкала времени. Почему? Какие аналогии? Демографам, геронтологам, биологам есть над чем подумать. В этом и заключается эффект математического моделирования. - А есть модели, отражающие влияние образа жизни на ее продолжительность? Василий Новосельцев: Я уже говорил, что моделирование позволяет предположить, что ожидаемая продолжительность жизни у мужчин и женщин различается и зависит от образа жизни. На эту тему очень много данных со всего мира собрали американцы, а мы их обработали. - Но почему физические нагрузки сокращают жизнь женщины? Василий Новосельцев: Меня это тоже удивило. Но это модель данных. В ней системные механизмы старения не рассматриваются. А к системной модели еще надо подойти. Пока не совсем ясно, как проводить такие исследования, как учитывать их результаты в моделировании Анатолий Михальский: И все-таки математика нередко позволяет нащупать тот уровень, на котором можно найти объяснение труднообъяснимым биологическим процессам или явлениям. - На сегодняшний день в геронтологии более 300 теорий старения. Реально ли объединить их в одну? Василий Новосельцев: Старение представляет собой очень многофакторный процесс. Не удивительно, что пока объединить эти теории не удается. Хотя попытки такие были. В 1999-2000 годах мы сотрудничали с Анатолием Яшиным, работавшим в то время в Институте Макса Планка в Германии (сейчас он директор Научного центра по вопросам народонаселения, здравоохранения и старения (Университет Дьюка (США)). Он тогда сформулировал такую задачу: объединить все теории в одну. Но потихоньку его настрой и энтузиазм заметно поубавились. Анатолий Михальский: Кстати, замечено, что современные биологические проекты по затратам соизмеримы с космическими и атомными проектами. - Большинство научных экспериментов проводится в лабораторных условиях. Но естественные условия жизни мало похожи на лабораторные. Василий Новосельцев: Действительно, популяции в дикой природе живут не так, как в лабораториях. Поэтому сейчас стали делать эксперименты, приближенные по своему дизайну к естественным природным условиям. Например, в лаборатории муху кормят регулярно, а в дикой природе нет. Тогда в условиях экспериментов тоже стали кормить мух случайным образом… Анатолий Михальский: Я уже упоминал профессора энтомологии Джеймса Кери. - Как ему это удается? Анатолий Михальский: Кери ставит эксперименты в промышленных масштабах. На севере Мексики есть фабрика, на которой миллионы и миллионы мух выращивают, стерилизуют и выпускают в естественную среду. Эти мухи вытесняют естественных обитателей тех мест. И уже в природе за ними ведется наблюдение. Василий Новосельцев: Такие исследования - это уже биодемография. Абсолютно новая наука - синтез биологии с демографией и энтомологией. И вот, в конце 70-х годов демограф Натан Кейфиц (Nathan Keyfitz) высказал интересную мысль, которая до этого, видимо, не приходила в голову исследователям: почему бы не считать, что популяция состоит из различных членов (а статистика всегда считает, что популяция - это ансамбль, в котором каждый элемент подобен другому). То есть, в популяции присутствуют более слабые и менее слабые особи: более подверженные и менее подверженные. Из этого предположения появилась теория неоднородной популяции и была разработана математическая теория гетерогенности (неоднородности), объясняющая, почему с возрастом замедляется рост смертности. Но важно понимать, что замедляется смертность в популяции. Смертность отдельных индивидуумов при этом вовсе не обязана замедляться и может расти следуя закону Гомпертца. Анатолий Михальский: Интересно, что эффект неоднородности присущ не только живым популяциям. В Институте Демографических Исследований Общества Макса Планка поставили эксперимент над лампочками. Включили 50 тысяч лампочек и долго вели наблюдение за тем, как они перегорают. Была получена такая же кривая замедления интенсивности выхода из строя лампочек, что и для живых популяций. - Получается тренировка малыми стрессами. Василий Новосельцев: В биологии это называется «гормезис долголетия». Анатолий Михальский: Я, в частности, обсчитывал такие данные. Интересно, что эффект этой тренировки сказывается в конце жизни. Изначально молодому и здоровому организму такая тренировка ни к чему. Но после окончания репродуктивного периода, когда системы устаревают и изнашиваются, она начинает сказываться. - У математиков есть объяснение, почему человек стареет? Каковы первопричины старания? Василий Новосельцев: В процессе эволюции возникли разные способы борьбы с повреждениями, которые в принципе позволяют не стареть. Логичный вопрос: так почему же организмы стареют? Но оказывается, эволюции не выгодно, чтобы организмы тратили много энергии на борьбу с повреждениями, лучше уж использовать их для репродукции. Поэтому они стареют. - Значит, необходим некий баланс: «...Холод, голод и половое воздержание». Так, кажется, Вы написали в одной из своих работ? Василий Новосельцев: …и генетические модификации. Василий Новосельцев: Американский исследователь Роберт Аркинг (Robert Arking) из Детройта путем селекционного отбора создал популяцию долгоживущих мух. Для этого ему использовал 21 поколение дрозофил. - Тогда возникает противоречие. Вы сказали, что продолжительность жизни у лабораторных мух постепенно убывает. Может быть, среда обитания человека, которую вы назвали искусственной, для него давно стала естественной? Василий Новосельцев: Наука вообще полна противоречий! Но одно дело естественная среда обитания, другое - искусственная среда, одно дело - естественный отбор, другое - искусственный. - Приведите, пожалуйста, несколько примеров практических результатов математического моделирования? (может привести примеры, касающиеся непосредственно старения и продолжительности жизни?) Василий Новосельцев: Еще в 2001 году мы на компьютере повторили классические эксперименты знаменитого эволюционного биолога Джона Смита (John Maynard Smith) 1960-х гг., в результате чего удалось объединить две теории старения - теорию темпа жизни и пороговую теорию. В 2003 году научились анализировать индивидуальные паттерны репродукции. В прошлом году смогли предсказать продолжительность предстоящей жизни. Все это относится, конечно, к плодовым мушкам. - На чем? Василий Новосельцев: На роботах. Они сейчас механизируют все сферы народной жизни, чтобы предотвратить дефицит кадров. И за пожилым человеком у них будут ухаживать роботы. Они уже сегодня делают таких маленьких, мягких, миловидных роботов Паро, в виде морских котиков. Внутри у этого робота находятся осязательные сенсоры, позволяющие ему самостоятельно передвигаться. Игрушка очень дружелюбна, умеет говорить ласковые слова и «общаться». Анатолий Михальский: Но это плохой выход. - А хороший еще возможен? Анатолий Михальский: Давно обсуждается идея сделать материнство профессией. Тогда женщина может воспитывать детей, иметь социальный статус, получать достойное пособие, социальное и пенсионное обеспечение. И стоимость этой инициативы уже посчитана. - Над чем сейчас вы работаете? Василий Новосельцев: В прошлом году мы с Анатолием Ивановичем занимались старением популяций москитов и показали, что учет старения позволяет уточнить прогноз начала развития эпидемии. Анатолий Михальский: Я среди прочего, сейчас разрабатываю модель, которая описывала бы данные по влиянию ограничения питания на продолжительность жизни и на репродукции. Очень много разных данных. И до сих пор считалось, что сам факт ограничения калорийности влияет на продолжительность жизни. Но все не так просто. Оказалось, что влияние оказывает не калорийность пищи, а скорее ее состав: в первую очередь содержание в продуктах протеинов. - Сегодня математическое моделирование востребовано государством? Василий Новосельцев: Нет, пока не особенно. Возможно, потому, что математическое моделирование в геронтологии - дисциплина очень молодая, ей от силы лет 10-15. И потом, математика требует некоторого особого образования для полноценного своего восприятия. Анатолий Михальский: Индивидууму, принимающему решения, часто бывает трудно осознать проблемы популяции. Джеймс Вопель, директор Института Демографических Исследований Общества Макса Планка в Германии, сравнил демографа с буревестником, который, видя с высоты приближение бури, пытается криком предупредить политика, отдыхающего на пляже. Василий Новосельцев: Но в прошлом году, наконец, Академией наук были заявлены три новые приоритетные научные направления. - Есть повод для маленького праздника. Василий Новосельцев: Вообще да, хотя пока слова «старение», «геронтология» в академических планах не фигурирует. - Вот это странно. В цивилизованных странах изучают механизмы старения, ищут способы борьбы с ним, а у нас подобные исследования - частная инициатива. И это на фоне постарения и вымирания населения страны. Василий Новосельцев: Мне кажется, что общее мнение пока такое - зачем жить долго, если жить так сложно. В нашем институте инженер получает зарплату 3,5 тысячи рублей. Как можно жить на эти деньги, если квартплата составляет те же 3,5 тысячи? Ясно, что человеку при таких условиях не захочется жить долго. - То, о чем Вы говорите - серьезная многоплановая проблема: политическая, экономическая, мировоззренческая. Но, она не неразрешимая. Ее решение во многом зависит от активной позиции граждан страны. Василий Новосельцев: Здесь мы с вами согласны. Москва, июль-август, 2008 |